DNA fingerprinting of tetraploid cherry germplasm using simple sequence repeats : USDA ARS

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DNA fingerprinting of tetraploid cherry germplasm using simple sequence repeats

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SSR fragments found in tart cherry (Prunus) accessions as reported in the paper "DNA fingerprinting of tetraploid cherry germplasm using simple sequence repeats" by Claudio Cantini, Amy F. Iezonni, and Warren F. Lamboy, to be published in 2001 in the Journal of the American Society for Horticultural Science.

Note: An entry of "ND" in the table means data was not able to be scored for that accession/primer combination.

Accession Name	Accession Number	pchpgm3	PS08E08	PMS2	PMS30	PMS49	PMS3	PceGA25	PMS40	PceGA59	PMS67
Altaiskaja o.p.	PI 592857	189 174	182 172	145 138 137 135	171 136 132 124	136	186 175 155	192 183 161	111 103 88	226 219 194 186	191 170 150
Amarena di Pescara	PI 592861	189 183 174	182 172	145 135	136 124	136	ND	175 161	103 100 96 88	226 194 189 186	ND
Ujfehertoi Furtos	PI 592878	189 183 176	184 182 172	145 135	175 142 132 124	122	180 175	185 173 161	115 111 100 98	226 194 189 186	176 150 148
Cigany 59	PI 592853	189 183 174	182 172	145 135	136 124	136 79	185 175 155	175 161	106 103 98 88	226 194 189 186	162 150 148
Crisana	GPRU 81	189 183 176	185 182 172	145 135	175 142 132 124	122	186	186 161	115 111 100 98	226 194 189 186	150 148
Csengodi Csokros	PI 592860	189 183	185 182 172	145 135	175 171 159 124	144 79	190 185 177	175 173 161	103 100 98 96	226 189 186	170 150 148
Del Nord	PI 592844	189 183 174	182 172	145 135 132	ND	156 136 96	197 185 175	197 175 161	106 103 98 88	226 194 189 186	168 150 148
Dropia	PI 592859	189 183 174	182 172	145 135 132	171 124	156 136	195 185 177 175	175 173 161	103 100 88	226 194 186	178 170 162 150
Dwarfrich	PI 592842	189 183 176 174	174 172	145 138 137	136	140 120	200 185 180	188 183 175	111 103	226 194 189 186	150 148
Engleise Timpurii	PI 592855	183 176 174	182 172	145 137 132	175 171 124	160 156 100 96	175 172	195 186 161	111 103 100	194 189	148
English Morello	PI 592847	189 183 178	185 182 172	150 148 145	171 161 132 124	160 156 100 96	190 180 172	195 173 161	111 100 98 88	226 189 186 181	178 172 162 150
Erdi Botermo	PI 592856	189 183 178	185 182 172	145 135 132	171 161 142 132	185 122	195 177 175	198 186 173 161	111 100 88	226 194 189 186	176 172 150 148
Erdi Jubileum	PI 592868	189 183 174	182 172	135 132	175 171 124	156 122	200 186	186 175 173 161	115 100 98	226 194 189 186	170 150 148
Erdi Nagygyumolesu	GPRU 76	189 176 174	185 182 174 172	145 137 132	134 132 124	140 136 79	180 177 169	185 181 178 161	113 111 108 106 100	226 181	191 168 150
Favorit	PI 592876	189 183 176	182 172	145 135 132	134 124	156 122	200 195 175	185 175 161	111 103 100	194 189 186	162 150
Ferracida	PI 592883	189 183 178	185 182 172	145 135 132	171 161 132 124	156 96	195 186 177 169	195 173 161	111 100 98 88	226 189 186 181	178 172 162 150
Fructbare von Michurin	PI 592870	183 178 174	182 172	145 137 135 132	171 136 124	162 156 136	188 167 157	198 161	115 103 96	226 189 186	191 170 150
Griotte Moskovskii	PI 592890	189 183 174	182 174 172	145 132	171 124	162 156 136	188 180 177	195 173 161	100 98 88	226 194 189 186	181 162 150
I 13 (61)	GPRU 75	189 183 174	182 172	145 135 132	175 171 136 124	156	197 188 172	175 173 161	103 100	226 194 189 186	176 170 148
I 24 (63)	GPRU 74	183 174	182 172	145 135 132	171 136	162 156 136	197 177 175	195 186 183 161	111 100 88	194 189 186	172 170 150
Ideal o.p. (Russia 6)	PI 592858	189 183 174	182 172	137 135 132	171 132 124	156 136 96	188 177	195 186 183	111 103 98 88	226 219 194 186	181 170 150
III 18 (12)	GPRU 80	189 183 174	185 182 172	145 138 137 132	175 171 142 134	156	195 175	195 175	111 100 96	226 194 189 186	181 174 170 148
Kelleriis	PI 592877	183 176 174	185 182 172	145 135	171 142 132 124	136	180 177	185 175 173 161	115 100 88	226 194 186	172 150 148
Korai Pipacs Meggy	PI 592875	189 183	182 172	145 132	161 132 124	156 122	180 177	185 161	115 100 98 88	226 189 186	178 150 148
Lebedjanskaja o.p.	GPRU 77	189 183	185 182 172	145 135 132	171 136 124	156	185 175 169	175 173 161	111 98 96 88	226 189 186	168 162 150 148
Lubskaya	PI 592881	189 183 178	182 172	145 132	124	156 136	185 175 155	175 161	106 103 100 98	226 194 189 186	170 162 154 150
Maliga Emleke M172	PI 592862	183 176	182 172	145 135 132	175 171 132	144 136	200 197	195 186 161	111 100	194 189 186	170 150 148
M209	GPRU 70	189 183 174	182 172	145 135	124	79	195 185 175	195 175	106 103 98 88	194 189 186	154 150 148
Mari Timpurii	GPRU 78	189 183	185 172	145 135 132	175 171 142 124	156 122	195 180 175	173 161	115 111 100	226 189	176 150 148
Mesabi	PI 592849	189 183 178	185 182 172	145 135 132	134 124	156 96	195 185 175 167	195 173 161	111 103 100 88	226 189 186 181	162 154 150
Meteor	PI 592848	189 183 178	182 172	145 138 135 132	161 134 124	136 120	195 185 169	195 192 175 173	111 100 88	226 189 181	174 172 170 150 148
Meteor Korai	PI 592848	189 183	185 182 172	145 135 132	175 171 161 124	185	190 177 172 167	198 186 173 161	111 98	226 186 181	176 162 148
Mocanesti 16	PI 592879	189 183 178	182 172	145 138 132	124	112	186 175	195 183	111 103 88	217 200 194 186	162 148 144
Montmorency	PI 592845	189 183 178	185 182 172	145 135 132	171 161 132 124	156 96	195 186 177 169	195 173 161	111 100 98 88	226 189 186 181	178 172 162 150
Nefris	PI 592880	183 178 176	182 172	150 145 132	171 142 132 124	156 136	188 175	181 165 161	113 111 98	226 189 186	162 150
North Star	PI 592841	189 183 174	182 172	145 135 132	175 171 136 124	162 156 136 120	195 172 155	175 173 161	103 100 98	226 194 186	176 170 150 148
Oblacinska	PI 592873	189 183 174	182 172	145 135	171 136 124	136	186 177 175	175 173 161	103 100 96 88	226 194 189 186	170 168 150 148
Prunus fruticosa BMs4 o.p.	PI 592887	189 183 176	185 182 174 172	145 137 132	175 171 124	136	195 175	185 183 181 173 161	111 100 98	226 194 189 186	174 150 148
Prunus fruticosa BMT3 o.p.	PI 592884	189 183 176 174	185 182 172	150 145 138 137	171 136 134 124	136 127	185 177 172 152	192 161	118 111 103 100	226 194 186 181	172 168 150
Prunus fruticosa BS2 o.p.	PI 592888	189 174	172	150 148 145	136 132 124	136 112 92	180 177 175	183 181 178	115 111 108 88	226 194 181	174 170 154 150
Prunus fruticosa Bt1 o.p.	PI 592886	189 183 176	185 182 174 172	145 137 135	142 136 132 124	136 122	200 180 175 157	186 183 161	115 113 111 98	226 194 189 186	178 176 150 148
Prunus fruticosa Pazal o.p.	PI 592885	189 183 174	182 172	150 145 137 135	171 136 132 122	136 122	188 180 175 167	195 188 161	108 103 100 96 88	226 194 186	178 176 150 148
Pandy 114	PI 592867	189 183 176	185 182 172	145 135	175 142 132 124	144 122 79	200 175	185 161	111 100 98	226 194 189 186	148
Pandy 279	GPRU 67	183 176	172	145 135	142 134 124 119	122	ND	161 145	106 103 96 88	226 194 189 186	ND
Pandy 35	GPRU 66	189 183 176	185 182 172	145 135	142 132 124	122 79	197 180 175	185 161	115 111 103 100	226 194 189 186	150 148
Pandy 48	GPRU 68	189 183 176	ND	145 135	ND	122	ND	186 161	ND	226 186 181	ND
PI 592843	PI 592843	189 176 174	ND	145 137	124	136 112	177 152	192 173	111 88	226 194	150
PI 592850	PI 592850	189 183 176 174	174 172	145 137	124	136	188 167 157	181 161	118 111 88	226 194 189	170 162 150
PI 592851	PI 592851	189 176 174	174 172	152 145 138 137	134 124	140 127 112	177 152	188 173	115 111 106 96	226 194	168 150
PI 592852	PI 592852	189 183 176 174	182 172	145 138 137	134 124	136 127 112	185 177 157 152	195 181 161	113 106 88	226 206 194 189	170 150 148
Pozog 29	PI 592854	189 183 174	182 172	145 135	175 171 136 124	136	200 185 177 175	175 173 161	103 100 96 88	226 194 189 186	170 168 150 148
Rexelle	GPRU	183 174	182 172	145 138 135	171 136 124 119	136 100	177 155	175 173 165 161	106 103 100 88	221 217 194 184	191 174 170 150
Rheinische Schattenmorelle	PI 592846	183 178 174	182 172	145 135 132	171 136 124	162 156 136	195 185 177 155	175 173 161	103 100 96 88	226 194 189 186	172 170 150
Sarandi	PI 592882	189 183 174	182 172	145 135	171 142 132 124	136 122	175	186 175 173 161	111 103 100	226 194 189 186	176 170 150 148
Studencheskaya o.p.	PI 592872	189 183 174	182 172	145 137 135 132	171 154 136 124	162 156 136	188 180	195 183 165 161	103 100 98 96 88	226 189 186	181 170 162 150
Sumadinka	PI 592871	183 178 176	182 172	145 135 132	171 142 132 124	136	188 175	ND	111 98	ND	162 150 148
Surefire	PI 592840	183 176 174	182 172	145 135 132	142 124	156 122 112	185 180	195 185 161	115 106 103 100	194 186 181	154 150 148
Tschernokorka	PI 592869	189 183 178	185 182 172	145 135	171 124	156 136	186 177	173 161	100 98 96 88	226 189 181	172 170 150
Ukrainische Griotte	PI 592865	189 183 174	182 172	145 135	171 136 124	136	177	175 161	103 100 96 88	226 194 189 186	162 150 148

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