Using SSRs for DNA fingerprinting germplasm accessions of grape species : USDA ARS

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Using SSRs for DNA fingerprinting germplasm accessions of grape species

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R alleles (base pair sizes) at the loci, VVS2, VVS4, VVMD6, VVMD7, and VVMD8,
analyzed for the 110 grape accessions discussed in the paper
"Using simple sequence repeats (SSRs) for DNA
fingerprinting germplasm accessions of grape (Vitis L.) species"

by Warren F. Lamboy and Christopher G. Alpha, published in the
Journal of the American Society for Horticultural Sciences,
Volume 123(2), p. 182-188, 1998.

Accession Name	Accession Number	VVS2 allele 1	VVS2 allele 2	VVS4 allele 1	VVS4 allele 2	VVMD6 allele 1	VVMD6 allele 2	VVMD7 allele 1	VVMD7 allele 2	VVMD8 allele 1	VVMD8 allele 2
V. acerifolia	PI 318684	141	159	163	185	195	215	251	251	177	183
V. acerifolia	PI 588144	151	151	175	185	215	215	243	251	173	185
V. acerifolia	PI 588442	125	133	155	175	204	215	251	253	169	183
V. acerifolia	PI 588448	151	151	185	185	203	206	251	251	159	179
V. aestivalis	PI 588145	123	141	167	175	209	213	235	241	157	179
V. aestivalis	PI 588182	125	125	159	177	213	219	235	241	157	159
V. aestivalis	PI 588626	127	143	163	185	204	204	241	241	159	181
V. amurensis	PI 588382	129	139	173	177	209	209	239	239	149	157
V. amurensis	PI 588420	131	143	173	179	207	207	239	251	147	157
V. amurensis	PI 588640	125	129	173	177	207	209	239	239	149	166
V. arizonica	DVIT 1269	123	139	179	181	213	213	245	251	135	168
V. arizonica	DVIT 1872	145	145	175	175	209	215	231	231	176	191
V. arizonica	DVIT 2211	121	151	165	181	215	215	245	245	135	164
V. californica	DVIT 1275	135	133	173	173	209	209	241	241	149	149
V. californica	DVIT 1360	135	145	173	175	207	209	239	239	143	149
V. californica	DVIT 1361	135	135	173	175	200	200	239	239	141	149
V. californica	DVIT 1836	141	141	167	169	200	209	263	263	137	199
V. cinerea	PI 588199	131	143	175	175	209	209	231	231	157	167
V. cinerea	PI 588210	127	135	175	175	207	209	231	231	166	172
V. cinerea	PI 588220	131	131	175	175	209	209	231	231	157	175
V. cinerea	PI 588222	143	153	175	175	209	209	231	231	164	169
V. cinerea	PI 588447	131	147	175	175	209	209	231	231	157	173
V. cinerea	PI 588460	143	143	175	175	209	209	231	231	155	161
V. cinerea	PI 588688	147	149	175	179	209	209	231	231	166	166
V. coignetiae	PI 588058	133	149	173	187	207	215	244	244	155	155
V. coignetiae	PI 588451	129	155	181	185	215	215	239	251	147	187
V. girdiana	DVIT 1379	145	145	179	179	217	217	241	241	149	149
V. girdiana	DVIT 1380	145	145	179	179	190	215	241	241	149	166
V. girdiana	DVIT 1389	145	145	173	179	204	215	241	257	159	159
V. girdiana 'Redlands'	DVIT 1387	137	145	179	179	213	215	241	241	157	157
V. labrusca	PI 588173	123	125	177	177	207	207	235	241	157	157
V. labrusca	PI 588583	125	125	177	177	209	219	235	235	157	166
V. labrusca 'Alba'	PI 588165	125	125	177	177	207	207	235	243	157	166
V. labrusca 'Alexander'	PI 594349	123	151	175	175	200	200	235	249	143	147
V. labrusca 'Champagne'	PI 588307	125	133	168	177	200	200	235	235	157	166
V. labrusca 'Niagara Rosada'	PI 288688	123	133	175	177	200	200	235	241	164	164
V. labrusca 'Vergennes'	PI 588128	125	135	168	177	200	206	247	250	137	155
V. monticola	DVIT 1302	137	143	169	195	190	190	244	250	145	181
V. monticola	DVIT 1369	123	123	181	185	203	213	233	259	157	159
V. monticola	DVIT 1576	123	137	181	181	227	227	233	251	157	173
V. monticola	DVIT 1847	145	161	177	191	204	215	249	253	185	185
V. monticola	PI 588454	133	143	167	175	215	215	261	261	183	199
V. monticola	PI 588627	137	143	168	193	190	190	243	249	143	179
V. mustangenses	DVIT 1134	143	143	177	177	206	206	234	234	159	166
V. mustangenses	DVIT 1277	133	139	179	179	206	211	234	234	197	197
V. mustangenses	DVIT 1577	139	159	177	179	206	206	235	235	166	190
V. mustangenses	DVIT 1844	139	139	179	179	217	217	233	233	149	149
V. palmata	DVIT 2227	167	167	175	177	217	217	233	237	175	181
V. palmata	DVIT 2228	137	137	175	175	213	213	234	234	159	179
V. palmata	PI 588155	137	191	159	177	207	217	217	233	149	159
V. palmata	PI 588201	163	175	167	185	207	211	233	233	164	164
V. palmata 'Cache 8'	PI 588233	133	133	177	177	207	217	233	235	164	187
V. piasezkii	PI 588465	129	129	175	175	209	209	229	237	137	141
V. riparia	PI 588054	129	133	177	181	204	215	251	265	147	177
V. riparia	PI 588259	133	133	175	179	204	215	239	251	169	183
V. riparia	PI 588262	143	145	175	175	204	215	244	251	183	185
V. riparia	PI 588271	137	139	185	189	204	215	251	251	155	179
V. riparia	PI 588273	139	141	191	191	215	215	255	257	177	179
V. riparia	PI 588435	137	159	177	185	215	225	139	139	173	181
V. riparia	PI 588436	125	151	168	179	200	215	239	255	143	183
V. riparia	PI 588438	137	143	185	193	204	206	244	251	155	183
V. riparia	PI 588439	141	159	185	187	204	215	251	251	163	179
V. riparia	PI 588440	141	143	175	185	204	213	259	263	173	199
V. riparia	PI 588458	133	141	175	185	204	206	251	253	169	179
V. riparia	PI 588459	133	139	181	181	215	215	244	257	179	179
V. riparia	PI 588483	143	145	168	173	215	215	239	239	164	175
V. riparia	PI 588565	141	141	185	187	215	215	251	251	193	199
V. riparia	PI 588580	143	159	191	191	204	204	251	251	181	181
V. riparia	PI 588586	139	139	185	191	204	206	239	251	177	177
V. riparia	PI 588710	137	143	185	185	225	225	251	251	167	167
V. riparia 'Gloire'	PI588214	141	145	167	185	204	215	251	265	181	183
V. riparia ' Quebec'	PI 588345	141	143	167	168	215	215	239	239	173	177
V. riparia 'Zumbrunner'	PI 594344	137	137	173	175	215	215	239	245	169	179
V. rotundifolia	DVIT 1145	137	139	177	179	206	215	233	261	175	175
V. rotundifolia 'Albemarle'	DVIT 1738	153	153	175	177	200	200	245	245	157	168
V. rotundifolia	DVIT 1743	149	149	177	177	195	195	243	243	169	169
V. rotundifolia 'Stucky'	DVIT 150	131	149	185	197	204	213	241	251	163	173
V. rupestris	PI 588143	137	159	177	185	204	204	261	261	169	175
V. rupestris	PI 588147	133	133	179	185	204	204	251	259	171	191
V. rupestris	PI 588160	133	141	189	189	204	204	259	261	147	163
V. rupestris	PI 588223	139	141	173	181	213	213	243	251	164	168
V. rupestris	PI 588224	137	137	173	181	215	215	251	261	168	171
V. shuttleworthii	DVIT 1713	145	145	177	177	207	207	235	235	159	159
V. shuttleworthii	DVIT 1714	145	145	185	185	195	206	235	235	159	199
V. shuttleworthii	DVIT 2249	147	147	177	185	207	207	235	265	131	159
V. shuttleworthii 'Kissimmee'	DVIT 2387	137	145	183	183	207	207	235	235	159	191
V.vinifera 'Cabernet Sauvignon'	POOL V21-2-10	139	151	168	175	206	207	239	239	139	155
V.vinifera 'Chardonnay' clone 95	POOL RS3-18-20	137	143	168	173	200	209	239	243	137	143
V.vinifera 'Feteasca Alba'	PI 348888	133	133	168	169	200	208	247	253	139	143
V.vinifera 'Merlot'	POOL RS1-36-31	139	151	168	175	200	207	239	247	139	155
V.vinifera 'Morio Muscat'	PI 588425	123	143	175	175	190	209	247	249	137	137
V.vinifera 'Pinot Noir'	POOL RS1-38-31	137	151	168	173	200	200	239	243	137	139
V.vinifera 'Riesling'	POOL V21-3-4	143	151	168	168	206	209	249	257	139	143
V.vinifera 'Rkaziteli'	PI 588177	133	141	169	175	209	211	247	253	139	166
V.vinifera ' Saperavi'	PI 588691	133	145	169	169	209	209	239	239	139	143
V.vinifera 'Tarnau'	PI 313922	137	141	167	167	204	209	239	251	157	177
V.vinifera 'Thompson Seedless' mutant	PI 588236	145	151	155	175	207	209	239	253	141	155
V.vinifera 'Voignier'	PI 594339	131	133	168	181	200	200	237	239	147	179
V.vinifera ' West Freesia'	PI 588708	133	135	168	175	190	209	247	249	139	139
V. vulpina	PI 588133	131	155	187	187	209	209	233	237	161	169
V. vulpina	PI 588142	135	135	173	177	209	209	239	239	159	174
V. vulpina	PI 588185	125	155	167	168	206	209	247	249	137	166
V. vulpina	PI 588356	131	143	175	175	209	209	231	231	157	167
V. vulpina	PI 588679	137	173	168	168	206	206	239	241	166	187
V. x andersonii	PI 588392	137	143	175	185	207	209	235	235	157	173
V. x champinii	PI 588371	125	125	168	175	207	207	234	235	157	166
V. x champinii 'Salt Creek'	PI 588123	137	139	177	179	207	215	233	261	173	195
V. x doaniana	PI 588149	139	143	175	185	215	215	251	259	179	183
V. x novaeangliae	PI 588257	141	141	177	185	204	204	241	251	157	179
V. x yenshanensis	PI 588421	131	161	177	177	200	209	239	253	179	199

U.S. DEPARTMENT OF AGRICULTURE

Plant Genetic Resources Unit (PGRU): Geneva, NY